膜蛋白存在的三種方式包括：

　　1. 跨膜蛋白：跨膜蛋白是一類能夠穿過細胞膜的蛋白質。它們通常由一段或多段互相連接的螺旋狀、折疊狀或β折疊狀的結構域組成，可以跨越細胞膜的雙層，并與其內外兩側的環境相互作用。跨膜蛋白在細胞內外之間傳遞信號、調節物質的通道、參與細胞識別等方面發揮重要作用。

　　2. 嵌入膜蛋白：嵌入膜蛋白是指部分域或具體區域嵌入到細胞膜中的蛋白質。這些蛋白質通常由靠近細胞膜的一段或幾段結構域組成，可以通過疏水性相互作用與細胞膜相互作用。嵌入膜蛋白在參與細胞信號傳導、細胞膜結構的穩定性和功能的調節等方面發揮重要作用。

　　3. 膜外蛋白：膜外蛋白是指存在于細胞膜界面的蛋白質。它們通過與細胞膜上的其他蛋白質或分子相互作用，參與信號傳導、細胞黏附等重要的細胞功能。膜外蛋白通常通過具有特定結構域的蛋白質片段或信號肽與細胞膜相互作用，從而實現其功能。