并非所有腸易激綜合癥患者都存在腸道菌群失調。

　　1，腸易激綜合癥本身是多因素共同作用引發的功能性腸病，腸道菌群失調只是可能的誘發因素之一，并不是發病的必備條件。除了菌群異常之外，內臟高敏感性、胃腸動力紊亂、腸道感染后炎癥殘留、長期精神焦慮壓力過大、遺傳易感性等，都可以單獨或共同誘發腸易激綜合癥發作。

　　2，從臨床研究數據來看，目前國內外統計僅40%~60%的腸易激綜合癥患者可檢測出明確的腸道菌群組成異常，剩下近半數患者的腸道菌群豐度、結構都和健康人群沒有顯著差異，并不會出現菌群失調的問題。

　　3，臨床上沒有菌群失調的腸易激病例十分常見，比如長期高壓狀態下誘發的腹瀉型腸易激、先天性內臟敏感引發的便秘型腸易激，這類患者調整情緒、改善生活狀態就能明顯緩解癥狀，不需要進行針對性調菌群治療，也能側面說明腸易激不都伴隨菌群失調。