廣義上三文魚屬于大馬哈魚的范疇，但消費市場中常見的三文魚和大馬哈魚，是完全不同的兩類食用商品魚，二者區別清晰。
1. 分類和產地不同。目前市場常見的三文魚多指大西洋鮭，屬于鮭科大西洋鮭屬，絕大多數是人工養殖，主產區在北歐挪威、智利等國；而國內通常說的大馬哈魚，一般指北太平洋流域的野生太平洋鮭（代表品種是狗鮭），屬于鮭科太平洋鮭屬，國產大馬哈魚主產自黑龍江流域，多為洄游季捕撈的野生個體。
2. 外觀與食用口感不同。三文魚的魚肉呈鮮亮的橙紅色，脂肪紋理清晰，白色脂肪線寬且均勻，入口細膩綿密，油脂感濃郁，質地軟嫩，適合生食；大馬哈魚的魚肉顏色更深偏暗紅色，脂肪含量低，紋理松散，肉質偏緊實有韌性，油脂感弱，生吃會有明顯腥氣和發柴的口感，一般要煎制、腌制后食用。
3. 市場定位與價格不同。三文魚是日料等高端餐飲的熱門生食食材，市場定位偏高，普通鮮切三文魚每公斤售價多在一百到數百元不等；大馬哈魚更多作為家常烹飪或者加工食材，常被做成腌魚、熏魚售賣，整體價格更低，通常僅為同重量三文魚的三分之一到一半左右。
